SCG1000單細胞高效液滴生成儀
譜今生物與森西賽智聯合研發的SCG1000單細胞液滴生成儀能為細胞或細胞核的高效分離和標記提供穩定的動力。
該儀器配備8個獨立控制的微流控芯片,支持1-8個樣本靈活上樣;
2.5 min 內快速生成油包水液滴,最大限度保障細胞活性;
單張芯片可捕獲18,000個細胞,細胞捕獲率高達60%;
兼容單細胞3’、5’、ATAC文庫制備需求。
詳情
產品介紹
譜今生物與森西賽智聯合研發的SCG1000單細胞液滴生成儀能為細胞或細胞核的高效分離和標記提供穩定的動力。
SCG1000單細胞數字液滴系統 (Digital Droplet System)可以自動化、一鍵式完成單細胞分離、捕獲及標記,搭配譜今生物自主研發的高通量單細胞試劑盒進行使用,同時配備單細胞數據分析軟件SCG Tools 進行數據分析。
產品原理
SCG1000單細胞單細胞液滴生成儀是基于微流控技術,將帶有條形碼和引物的編碼微球和單個細胞包裹為獨立的微反應體系。編碼微球尾部設計了Cell Barcode(標記細胞)、UMI(標記mRNA)和OligodT(與mRNA的polyA特異性互補配對),完成細胞及mRNA的分離標記,通過逆轉錄及高通量測序文庫的測序,獲取mRNA的3端序列,即可一次性獲得大量單細胞的基因表達數據,從而實現在單細胞水平進行轉錄組測序的目的。其能夠以高通量和單分子分辨率研究單個細胞表達譜,揭示復雜細胞群體的異質性,避免單個細胞的基因表達信號被群體的平均化所掩蓋,在腫瘤、發育生物學、微生物學、神經科學等領域發揮重要作用正成為生命科學研究的焦點。
實驗流程
① 單細胞分離標記
將制備好的單細胞懸液通過SCG1000液滴生成儀的“¥”字形通道形成為微反應體系。
② 單細胞文庫構建
在液滴內進行反轉錄;然后通過cDNA擴增、連接測序接頭等進行高通量測序文庫的制備。
③ 高通量測序
在高通量測序平臺進行測序,可兼容Illumina和華大測序平臺。
④單細胞數據分析
通過單細胞數據分析軟件SCG Tools自動完成細胞標簽的提取、數據質控、基因定量以及聚類分析等,并生成可視化的分析報告。
產品特點
樣本通量:8個單獨控制的微流控芯片,單次運行1-8個樣本;
細胞通量:單次可獲得500-18,000個細胞;
單細胞捕獲效率:2.5min中內生成15-20萬微液滴,細胞捕獲率60%;
雙細胞率:1000個細胞,雙效率約0.3%;
細胞范圍:可捕獲細胞直徑為5~50 μm的真核細胞(貼壁細胞、懸浮細胞、組織、血液等);
配備軟件分析系統:配備的單細胞數據分析軟件SCG Tools自動完成細胞標簽的提取、數據質控、基因定量以及聚類分析等,并生成可視化的分析報告;
適用文庫類型:兼容單細胞3’、5’、ATAC文庫制備需求。
儀器搬運方便:體積小,重量輕( 3.6 kg),方便搬運,便于隨時隨地進行單細胞實驗。
產品優勢
應用展示
一、醫學領域
腫瘤研究:
①腫瘤異質性分析:精確識別腫瘤組織中不同類型的癌細胞及其亞群,研究腫瘤的發生、發展機制以及對治療的反應差異機制(包括耐藥機制等)。
②腫瘤微環境研究:分析腫瘤微環境中的免疫細胞、基質細胞等其他非癌細胞的組成和功能狀態,研究免疫細胞與癌細胞的相互作用。
③治療監測和預后判斷:通過追蹤治療過程中腫瘤細胞的基因表達變化,監測治療效果,預測患者的預后情況,及時調整治療策略。
免疫系統疾病研究:分析免疫細胞的異質性,研究免疫系統疾病的發病機制,為疾病的診斷和治療提供新的靶點和思路。
感染性疾病研究:研究感染機制,分析感染過程中宿主細胞和病原體的相互作用,了解病原體的感染途徑、宿主細胞的免疫反應等。
生殖健康
①胚胎植入前遺傳學診斷:在輔助生殖技術中,對胚胎的單個細胞進行測序,檢測染色體異常、基因突變等遺傳缺陷,選擇健康的胚胎進行移植,提高試管嬰兒的成功率,降低出生缺陷的風險。
②生殖細胞發育研究:研究精子、卵子等生殖細胞的形成過程和發育機制。
二、生物學基礎研究領域
發育生物學:研究胚胎發育過程中不同細胞的分化、增殖和遷移等過程,揭示細胞命運決定的分子機制。
神經科學:分析神經系統中不同類型神經元細胞的基因表達和功能差異,研究神經元的發育、連接和信號傳遞機制,對于理解大腦的結構和功能以及神經系統疾病的發病機制具有重要意義。
三、藥物研發領域
藥物靶點發現:通過對疾病相關細胞的單細胞分析,發現新的藥物靶點,為藥物研發提供新的方向。
藥物篩選和評估:利用單細胞技術評估藥物對不同細胞的作用效果,篩選出具有治療潛力的藥物。可以分析藥物處理后細胞的基因表達、代謝變化等,預測藥物的療效和毒性。